W myśl regulaminów drużyny, które na koniec sezonu 2019/2020 zajmą w tabelach I i II ligi miejsca 3-6, wezmą następnie 6 i 10 czerwca udział w dwustopniowych barażach odpowiednio o awans do Lotto Ekstraklasy oraz do Fortuna I ligi. 

Zasady baraży w Fortuna I lidze:
I runda (6 czerwca 2020)
3. drużyna I ligi - 6. drużyna I ligi
4. drużyna I ligi - 5. drużyna I ligi

Finał (10 czerwca 2020)
zwycięzcy par barażowych z I rundy

Zasady baraży w II lidze:
I runda (6 czerwca 2020)
3. drużyna II ligi - 6. drużyna II ligi
4. drużyna II ligi - 5. drużyna II ligi

Finał (10 czerwca 2020)
zwycięzcy par barażowych z I rundy

Zarówno w I rundzie, jak i w finale barażów o wyłonieniu zwycięzcy zadecyduje jeden mecz, którego gospodarzem będzie drużyna sklasyfikowana wyżej w tabeli odpowiednio I i II ligi po sezonie zasadniczym.

Do Lotto Ekstraklasy i Fortuna I ligi poza zwycięzcą barażów awansują oczywiście także bezpośrednio mistrzowie i wicemistrzowie I i II ligi. Nie zmieniają się także zasady spadku z I i II ligi - zdegradowane zostaną nadal cztery ostatnie drużyny w tabeli.

źródło: PZPN.